Onder aan de Molendijk staat de Gereformeerde Kerk van Den Bommel. Het kerkje is gebouwd in 1890, nadat de gereformeerden zich hadden afgesplitst van de Nederlandse Hervormde Kerk. Tijdens de Watersnoodramp van 1953 kwam het kerkgebouw, net als bijna heel Den Bommel, onder water te staan. Een ingrijpende restauratie was nodig om het pand een nieuwe toekomst te geven. Dat gebeurde in 1955. In de kerk kwam toen ook een nieuw orgel te staan.

In de negentiende eeuw had de Nederlandse Hervormde Kerk te maken met enkele afsplitsingen. Ook in Den Bommel waren er gelovigen die zich niet langer thuis voelden in het grootste protestantse kerkgenootschap van Nederland. Zij bezochten eerst een tijdje kerkdiensten in Stad aan ’t Haringvliet, waar ook een afscheiding van de Hervormde Kerk tot stand was gekomen.

Maar vanaf 1890 hoefden de Bommelse gereformeerden op zondag niet langer naar buurdorp ‘Stad’ te wandelen. In dat jaar kreeg de nieuwe kerkgemeenschap namelijk een eigen kerkgebouw aan de Molendijk. Vooral J.C. Borgdorff had er erg voor geijverd. Hij was voorzitter van de kerkenraad en locoburgemeester van Den Bommel. Het kerkje had zwaar te lijden tijdens de Watersnoodramp van 1953. Twee jaar later was het gebouw echter alweer netjes gerestaureerd én voorzien van een nieuw orgel.

De Gereformeerde Kerk van Den Bommel kwam in het nieuws toen in 2004 de Protestantse Kerk in Nederland (PKN) ontstond. ‘Den Bommel’ ging niet mee in deze landelijke fusie van drie protestantse kerkgenootschappen. Samen met zes andere gereformeerde kerken richtte de Bommelse Kerk de Voortgezette Gereformeerde Kerken in Nederland op. Binnen een jaar volgde echter alsnog de aansluiting bij de PKN.

Even voorbij het kerkgebouw, richting het dorp, staat de voormalige pastorie van de Gereformeerde Kerk. Die is in 1921 gebouwd voor de eerste predikant. Naast de pastorie was de christelijke lagere school te vinden. Die is in 1969 afgebroken, nadat aan de Nassaustraat een nieuw schoolgebouw in gebruik was genomen. In dit gebouw is ook de openbare basisschool ondergebracht.